Skillnad mellan sgRNA och gRNA

sgRNA är den enda guiden RNA, en term som användes för att beskriva gRNA, medan gRNA är den guidade RNA, en RNA-molekyl användes för att specificera ett specifikt mål för endonukleaserna i CRISPR-systembaserat genomredigering. Därför, både sgRNA och gRNA är utbytbara termer som används för att beskriva samma molekyl. Det finns ingen stor skillnad mellan sgRNA och gRNA.

Både sgRNA och gRNA är syntetiska molekyler och liknar crRNA i CRISPR-systemet genom funktion. 

Viktiga områden som omfattas

1. Vad är sgRNA
     - Definition, Betydelse
2. Vad är gRNA
     - Definition, struktur, funktion
3. Vad är likheterna mellan sgRNA och gRNA
     - Översikt över gemensamma funktioner
4. Vad är skillnaden mellan sgRNA och gRNA
     - Jämförelse av viktiga skillnader

Nyckelbegrepp

Cas, CRISPR-baserad genomreaktion, gRNA, sgRNA, Spacer Sequence 

Vad är sgRNA 

sgRNA (single guide RNA) är en annan term som används för att beskriva gRNA. 

Figur 1: sgRNA

Vad är gRNA 

gRNA (guide RNA) är en kort, syntetisk RNA-molekyl som används i CRISPR-systembaserad genomredigering, en av de mycket specifika typerna av genommodifieringsverktyg. gRNA består av en ~ 20 bp lång nukleotidsekvens som binder till en mål-DNA-sekvens av genomet. Denna sekvens kallas för distanssekvensen. GRNA-molekylen är sammansatt av en ställningssekvens för bindningen av Cas, endonukleaset. Så, de två komponenterna i CRISPR-baserad genomredigeringen är gRNA och det CRISPR-associerade endonukleaset (Cas). Å andra sidan förändrar genomålet för CRISPR-systemet med sekvensen av gRNA. 

Figur 2: gRNA-roll i genomredigering

Tre typer av gRNA finns där baserat på syntesmetoden. De är syntetiskt crRNA, lentiviralt sgRNA och syntetiskt sgRNA.  

Likheter mellan sgRNA och gRNA 

• sgRNA och gRNA är små RNA-molekyler som används för att specificera målsekvensen till endonukleaserna i genomredigeringsverktygen baserat på CRISPR-systemet. 
• Båda har en 20 bp region som hybridiserar med DNA. 
• Båda är artificiella molekyler och förekommer inte i naturen. 
• Båda utför samma funktion, dvs funktionen crRNA utför i det naturliga CRISPR-systemet. 

Skillnad mellan sgRNA och gRNA 

Definition 

sgRNA (enkelriktad RNA) refererar till gRNA som användes i det artificiella CRISPR-systemet medan gRNA (guide-RNA) refererar till de korta syntetiska RNA-sekvenserna som specificerar målsekvensen för CRISPR-baserat genomredigering. 

• Både sgRNA och gRNA är utbytbara termer som används för att beskriva samma molekyl

Slutsats 

sgRNA är en annan term för gRNA medan gRNA är de korta syntetiska RNA-sekvenserna som används för att specificera målsekvensen i genomet för endonukleaset i CRISPR-systemet. Både sgRNA och gRNA är en av komponenterna i det CRISPR-baserade genomet redigering. Därför är huvudskillnaden mellan sgRNA och gRNA endast terminologin. 

Referens:

1. "CRISPR Guide." Addgene: CRISPR Guide, Tillgänglig här

Image Courtesy:

1. "15 Hegasy Cas9 DNA Tool Wiki E CCBYSA" Av Guido4 - Egent arbete (CC BY-SA 4.0) via Commons Wikimedia 
2. "CRISPR-Cas9-biolog" Av J LEVIN W - Egent arbete (CC BY-SA 4.0) via Wikimedia Commons