Skillnad mellan RNASE A och RNASE H

Huvudskillnad - RNASE A vs RNASE H
 

Ribonukleaserna är nukleaser som specifikt bryter ned RNA i mindre enheter. De kan delas in i två kategorier; endoribonukleaser och exoribonukleaser. Endoribonukleas är ett endonukleas som antingen kan bryta ned enkelsträngad eller dubbelsträngad RNA. Det klyver fosfodiesterbindningarna i en RNA-polynukleotidkedja. Exemplen är RNas A, RNas III, RNas Tl, RNas P och RNas H. Exoribonukleas är ett exonukleas som nedbrutit RNA genom att avlägsna terminala nukleotider från antingen 5'end eller 3'end av RNA-molekylen. Exemplen är RNas R, RNas II, RNas D och RNas PH. De nyckelskillnad mellan RNASE A och RNASE H är att RNas A är ett pankreatiskt ribonukleas som specifikt försämrar enkelsträngat RNA till mindre komponenter medan RNase H är ett icke-specifikt enzym som klyver RNA i RNA-DNA-hybrid i mindre enheter via hydrolytisk mekanism.

INNEHÅLL

1. Översikt och nyckelskillnad
2. Vad är RNASE A
3. Vad är RNASE H
4. Likheter mellan RNASE A och RNASE H
5. Jämförelse vid sida vid sida - RNASE A vs RNASE H i tabellform
6. Sammanfattning

Vad är RNASE A?

RNas A är ett pankreatiskt ribonukleas som specifikt klyver de oparmade cytosin- och uracilresterna vid 3'-änden av enkelsträngad RNA. RNase H arbetar vid en högre saltkoncentration (0,3M eller högre NaCl-koncentration). Den hydrolytiska reaktionen är två steg. Den bildar en 3'-fosforylerad produkt via 2'-, 3'-cyklisk monofosfat-mellanprodukt. Fastän den är specifik för enkelsträngad RNA vid högre saltkoncentration kan den också bryta ned dubbelsträngat RNA och RNA i RNA-DNA-hybrid vid lägre NaCl-koncentration (lägre än 0,3 M NaCl).

Bruce Merrifield syntetiserade först detta enzym. RNase A är ett mycket populärt enzym i molekylär forskning. Bovin pankreatisk RNas A är ett exempel på RNas A. Och det är ett av de hårdaste enzymerna som används i laboratoriet. Detta enzym behöver inte en koaktor för sin aktivitet. Det är ett mycket termostabilt enzym. RNas A är det första enzymet och det tredje proteinet till vilket en korrekt aminosyrasekvens detekterades. Detta enzym är mycket litet med 124 aminosyror och molekylmassa av 12600da. Och den har fyra histidinrester (His 12 och His 119 som involverar i katalytisk reaktion).

Figur 01: RNas A

RNas A kan isoleras genom kokning av ett råprov. När kokar alla andra enzymer nedbrytande återstående RNase A. RNase A är ett otroligt stabilt enzym. Detta enzym hämmar ribonukleasinhibitorprotein, tungmetall och uridinvanadatkomplex.

Vad är RNase H?

RNaset H är ett icke-specifikt ribonukleasenzym som kan bryta ned RNA i RNA-DNA-hybrid via hydrolytisk reaktion. RNas H spjälkar 3'-O-P-bindningen av RNA i en RNA-DNA-hybrid. I slutändan produceras 3'OH och 5'-fosfatterminerade produkter. I DNA-replikation spelar den en nyckelroll genom att ta bort RNA-primer när nya DNA-strängar bildas. Vid laboratoriebetingelser nedbryts det specifikt RNA i RNA-DNA-hybrid men inte DNA och ohybridiserat RNA. Och detta enzym används vanligtvis för att förstöra RNA-mallen efter det att den första komplementära DNA-strängen bildats under cDNA-syntesen.

Figur 02: RNas H

RNase H använder också i nukleasskyddsbestämningar. Det kan också införlivas med avlägsnandet av poly A-svansen från mRNA. RNase H har förmågan att förstöra det icke-kodande RNA inuti och utanför cellen. Metalljonerna krävs som kofaktorer för denna proteinaktivitet. En chelator (EDTA) kan användas för att hämma RNase H-enzymet.

Vad är likheterna mellan RNASE A och RNASE H?

• Båda är protein i naturen.
• Båda är endoribonukleas
• Båda kan bryta ned RNA.
• Båda utförs hydrolytiska reaktioner.
• Molekylära laboratorier använder båda dessa.

Vad är skillnaden mellan RNASE A och RNASE H?

RNASE A vs RNASE H
RNas A är ett pankreatiskt ribonukleas som specifikt klyver 3'-änden av oparmade cytosin- och uracilrester av enkelsträngat RNA vid högre saltkoncentration.	RNas H är ett icke-specifikt ribonukleasenzym som kan bryta ned RNA i RNA-DNA-hybrid via hydrolytisk reaktion.
Naturen av RNA Cleaving
RNas A spaltar specifikt enkelsträngad RNA vid högre saltkoncentration.	RNas H spjälkar RNA i RNA-DNA-hybrid.
Behov av ko-faktorer för aktivitet
RNas A behöver inte koaktorer för sin aktivitet.	RNase H behöver metalljoner som kofaktorer för dess aktivitet.
Inhibitorer av proteinaktivitet
Ribonukleasinhibitorprotein, tungmetall och uridinvanadatkomplex inhiberar RNAse A-aktiviteten.	En chelator (EDTA) hämmar RNase H-aktivitet.
RNA-primerfjernning i DNA-replikation
RNas A används inte för RNA-primeravlägsnande vid DNA-replikation.	RNas H används för RNA-primeravlägsnande i DNA-replikation
DNA-mallavlägsnande i komplementär DNA-syntes (C-DNA)
RNas A används inte för RNA-mallavlägsnande under komplementär DNA-syntes (C-DNA).	RNas H används för RNA-mallavlägsnande under komplementär DNA-syntes (C-DNA).
Avlägsnande av Poly-A-Tail i mRNA hybridiserad till Oligo (dt)
RNas A används inte för att avlägsna "poly-A-svans" i mRNA hybridiserad till oligo (dt).	RNas H används för att avlägsna "poly-A-svans" i mRNA hybridiserad till oligo (dt)

Sammanfattning - RNASE A vs RNASE H

Ribonukleaserna är nukleasenzymer som har förmågan att klyva RNA i mindre enheter. De är två typer; endoribonukleaser och exoribonukleaser. Endoribonukleas är ett endonukleas som har förmågan att bryta ned enkelsträngat eller dubbelsträngat RNA. Och det klyver fosfodiesterbindningen i en RNA-polynukleotidkedja. RNas A och RNas H är två endoribonukleaser. RNas A är ett bukspottskörteln-ribonukleas som specifikt klyver unparerade cytosin- och uracilrester vid 3'-änden av det enkelsträngade RNA vid högre saltkoncentration. RNase H är ett icke-specifikt ribonukleasenzym som kan nedbryta RNA i RNA-DNA-hybrid via hydrolytisk reaktion. Detta är skillnaden mellan RNase A och RNase H.

Ladda ner PDF RNASE A vs RNASE H

Du kan hämta PDF-versionen av den här artikeln och använda den för offlineändamål enligt citationsnotat. Var god ladda ner PDF-version här Skillnaden mellan RNASE A och RNASE H

Referens:

1.Karuturi, författare Amrutha. "17 behöver veta fakta om RNase A." AG Blog, 22 februari 2017. Tillgänglig här
2. "Ribonukleas." Wikipedia, Wikimedia Foundation, 5 jan 2018. Tillgänglig här  

Image Courtesy:

1.RNase A'By Ingen maskinläsbar författare. Vossman antogs (baserat på upphovsrättskrav)., (CC BY-SA 2.5) via Commons Wikimedia
2.'RNase H fix'By Ingen maskinläsbar författare. Vossman antogs (baserat på upphovsrättskrav)., (CC BY-SA 2.5) via Commons Wikimedia